阿笠博士的宅邸内，气氛异常凝重。变小后的工藤新一，费尽九牛二虎之力，凭借着只有两人才知道的童年糗事、秘密发明和共同经历，终于让目瞪口呆的阿笠博士相信了这个看似天方夜谭的事实——眼前这个眼镜后藏着聪慧眼神的小男孩，就是他那个才华横溢的高中生侦探邻居。
“所、所以……你真的就是新一？！”阿笠博士看着穿着不合身童装（临时从附近便利店买的）的工藤新一，仍然觉得难以置信。
“如假包换，博士。”柯南——工藤新一此刻不得不接受的新身份——推了推脸上用来稍作掩饰的黑框眼镜，声音稚嫩却带着熟悉的无奈和严肃，“是那个组织，他们喂我吃下了一种神秘的毒药，没想到竟然导致了身体退化。”
就在他们初步商量好对策，决定暂时隐瞒真相，并由阿笠博士作为“远方亲戚”代为照顾这个“孩子”时，门铃急促地响了起来。
“新一！新一你在里面吗？博士！”门外传来小兰焦急的声音。她因为久久联系不上新一，担心他是不是在热带乐园分开后遇到了什么麻烦，一路找到了关系亲近的阿笠博士家。
柯南（新一）的心猛地一跳，博士也瞬间慌了神。
“快！躲起来！”阿笠博士手忙脚乱。
“不行，来不及了！”柯南压低声音，“博士，按我们刚才说的做！”
门打开，小兰担忧的脸庞出现在门口：“博士，请问新一他……”
“啊，小兰啊……”阿笠博士努力让自己看起来自然，“新一他刚才打电话来了，说突然接到一个非常棘手的案子，需要紧急出国调查一段时间，可能很久都联系不上。”
“什么？出国？怎么会这么突然？”小兰愣住了，脸上写满了失落和不解，“他都没跟我说一声……”
就在这时，她注意到了博士身后那个怯生生探出头来的小男孩。小男孩戴着大眼镜，模样十分可爱，正好奇地望着她。
“博士，这位是？”
“啊，这个孩子啊，”阿笠博士连忙按照商量好的剧本说道，“他叫江户川柯南，是我一个远房亲戚的孩子，因为家里出了些事情，暂时要寄住在我这里一段时间。”
“柯南？你好呀。”小兰天生对小孩子有着温柔的亲和力，她蹲下身，对着柯南笑了笑，暂时忘却了新一不告而别的烦恼。
看着小兰近在咫尺的、充满关切的脸庞，柯南（新一）的心脏像是被什么东西攥紧了。他必须撒谎，必须隐瞒，不能让她卷入危险之中。他努力挤出一个符合年龄的、天真无邪的笑容：“姐姐好。”
“真是个可爱的孩子呢。”小兰摸了摸他的头。
阿笠博士看着这一幕，眼珠一转，计上心头，开始了他的“神助攻”：“哎呀，说起来真是头疼啊。小兰，你知道的，我这个人粗心大意，又老是埋头搞发明，实在不怎么会照顾小孩子。你爸爸是侦探，你家又是开侦探事务所的，环境应该比我这乱七八糟的实验室好多了。能不能……暂时让柯南寄住在你家啊？毛利侦探那边我会去说的，也会支付足够的生活费！”
“诶？住到我家？”小兰有些惊讶，但看着眼前这个“父母不在身边”、“看起来有点害羞”的孩子，母性和同情心顿时泛滥，“可是……爸爸他……”
“拜托了，小兰！就暂时一段时间！”阿笠博士双手合十恳求道。
小兰看了看博士，又看了看正用那双大眼睛（努力装出）期待眼神看着自己的柯南，终于心软了：“好吧……如果爸爸同意的话。我会照顾好他的。”
就这样，在阿笠博士的巧妙安排和柯南（新一）的默认下，他以“江户川柯南”的身份，顺理成章地住进了毛利侦探事务所，住进了小兰的家。
一切似乎暂时安顿了下来。每天都能看到小兰，以另一种身份守护在她身边，这原本应该是……值得庆幸的事情？柯南（新一）常常这样告诉自己。
身边的人，园子、老师、同学，甚至毛利小五郎，几乎所有人都认为小兰喜欢新一，而新一对小兰也确实与众不同，保护她、在意她，甚至会因为她而吃醋。就连工藤新一自己，在变小之前，也一直以为自己喜欢的、未来会在一起的人，就是小兰。那份青梅竹马的感情，深厚、自然，仿佛早已融入生命。