洪武七年（4071年）八月初一甲午日，皇帝亲自在新庙祭祀历代帝王。
从伏羲到元世祖，总共十七位帝王设为五个祭室，每个祭室分别用一头牛、一只羊、一头猪，一个祝官，每个帝王的神位前用竹笾和木豆各十个，簠、簋、登、铏各一个，酒爵各三个，丝帛各一段，都是白色的。
一共在宫殿的西阶设置了五个酒樽，又在宫殿的东阶设置了三个酒樽。
在祭祀前两日，皇帝要进行斋戒，陪祀的执事官也要一起斋戒。
祭祀前两天，太常卿上奏请求派遣中书丞相省察祭牲。
第二天清晨，丞相穿常服视察祭祀用的牲畜。
到了特定的那一天，皇帝穿着衮服、戴着冕旒，进入相应的场所并就座。
典仪官唱迎神，协律郎举起指挥旗，演奏《雍和》之曲。
太常卿上奏说：“有关部门已经准备完毕，请开始祭祀。”
皇帝拜了两拜，陪同祭祀的官员也都拜了两拜。
典仪官唱礼道：“进献帛品。”于是开始进行初献之礼。
皇帝来到洗手的位置，把圭插入腰带，洗手洗脸，抽出圭，来到放酒樽的地方，执事人员各自用酒爵盛上泛齐，协律郎举起指挥用的旗帜，演奏保和之曲，表演武功之舞。
皇帝来到三皇神位前，跪下，将圭插入带间，放置祭帛、进献酒爵，一共三次。
读祝官拿起祝文，跪着读完，皇帝取出圭，俯伏，起身，恢复平常站立的姿势。
接着，皇帝前往五帝神位前祭祀。
到三皇神位前，接着到汉高祖、光武帝、隋文帝神位前，再到唐太宗、宋太祖神位前，再到元世祖神位前，都和前面的仪式相同。
回到原位，再次下拜。
典仪官唱‘亚献礼’，协律郎举起指挥用的麾旗，演奏《中和之曲》，表演《文德之舞》。
各室执事分别按照爵位接受酒，然后将酒放在神位前，皇帝再次拜祭。
典仪官高唱行终献礼，协律郎举起麾旗，奏响肃和之曲，表演文德之舞。
仪同三司担任亚献。
典仪官高唱‘饮福酒，接受祭肉’。
皇帝来到饮福位，跪下，把圭插入腰带，执事人员跪着进献酒爵，皇帝接过酒爵，饮下福酒，把爵交还给执事人员，执事人员跪着进献祭肉，皇帝接受祭肉，把它交给左右的人，抽出圭，俯身伏地，起身，回到原位。
只有在位的官员行再拜之礼。
典仪官高声唱彻豆，协律郎举起指挥用的旗帜，演奏《凝和》之曲。
执事官各自到神位前撤下笾豆。
典仪官高唱送神，协律郎举起指挥用的旗帜，演奏《寿和》这首曲子。
皇帝再次下拜，在位的官员也都再次下拜。
典仪官高唱，读祝官捧着祝版，掌祭官捧着币帛、祭品，各自前往瘗埋的地方。
唱望瘗，协律郎举起麾旗，演奏《豫和之曲》。
皇帝前往望瘗位，将土填满土坑的一半。
祭祀完毕，祭祀的祝文对三皇说：“只有太昊伏羲氏画出了八卦，用来彰明自然规律，创造文字来开启人类文明。只有炎帝神农氏制造了耒耜来教导百姓耕种，品尝了各种草药来治病救人。只有皇帝轩辕氏，制作房屋和衣服时取法《易》中的卦象，创立音律、历法和官制来宣扬政治。他们都是承继天命登上皇位，通晓万物之理，成就天下之务，对百姓和后世有着极大功劳的人啊。我朱元璋凭借微薄的德行，承蒙上天保佑、民众襄助，君临天下，继承中国帝王的正统。我追念三位圣人去世已经很久了，他们的神灵在天上，永远存在，崇敬报答的礼节，不可以不周全。因此在京城开始新建庙宇，排列圣像，以及历代开国帝王的像，每年在春秋两季的第二个月进行祭祀，永远作为固定的制度。现在在刚刚举行奠祭礼的时候，恭敬地捧着牺牲、甜酒和众多祭品来祭祀，恭敬地希望您向上享受五帝的祭祀。”
祝文对五帝说：“金天氏帝君，五行中的金德顺应时运，凭借凤鸟来设置官职，道德承继三皇，是五帝中的首位。只有帝高阳氏，深沉宁静而有谋略，明晓事理，以洁净虔诚的态度祭祀，治理教化万民。只有帝喾高辛氏，聪明而有远见，明智