到这时，他去世了。
戊午日，皇上对朝廷大臣说：“国家政事的得失，与百姓的幸福或疾苦息息相关。君主和臣子之间，各自承担自己的责任，所做的事情不恰当，就应当迅速改正，不应该有隐瞒回避的情况。如果隐瞒回避不说，互相包容沉默，这既不是侍奉君主的正确做法，对自己也有不利之处。从今以后，你们都要尽心竭力，直言相告，不要隐瞒。”
秋季七月初一为壬戌日。
丁丑日，徐达、常遇春攻克庐州。当时庐州被包围已经很久了，将士们都饥饿困顿无法战斗。张焕与贾丑暗中与徐达勾结，表示愿意作为内应攻打东门，于是我军猛烈进攻，城中的各军全部前往东门救援，张焕趁机砍断吊桥，打开西门出城投降。徐达的军队进入城中，捉住了左君弼的部将吴副使，以及左君弼的母亲、妻子和儿子，把他们送到了建康，让指挥戴德看守他们。
戊寅日，皇帝命令平章常遇春会合邓愈以及金大旺的军队，讨伐江西上游尚未归附的郡县。
己卯日，左君弼的部将许荣献出舒城前来归降。皇上命令许荣返回舒城防守，让他征调安阳等五个翼的士兵和战马赶赴建康。
改庐州路为庐州府，设置江淮行省，命令平章俞通海代理行省事务来镇守此地。战争时期，百姓大多逃窜隐匿，俞通海每天都在招抚他们，处理政事有仁爱施惠（的表现），因此恢复本业的人很多。
壬辰日，中书省有个掾史因为在官员选拔中受贿，被按察司弹劾，按罪应当判处死刑。皇帝说：‘官吏接受贿赂买卖官职，见利而忘记国法，论罪本应处死，但法令刚刚施行，人们还没有全都知晓，暂且免死而处以杖刑，如果再犯，就不会宽宥了。’
平章常遇春、参政邓愈等人率领军队讨伐新淦的沙坑、麻岭、牛陂等山寨，将其平定，抓获了伪知州邓志明，送到建康，邓志明与他的哥哥邓克明都被诛杀。邓克明是新淦人，从小就是个无赖，在乡里肆意横行。等到红巾军贼寇攻陷临江，邓克明和弟弟邓志明也聚集民众起兵，依附贼寇首领陈普文，占据了新淦县的修德、钦风、太平、玉笥四个乡，于是又攻陷了抚州的乐安、崇仁、宜黄等县，自称元帅。陈友谅派兵掠夺新淦，邓克明率领部众归附他，陈友谅任命邓克明为右丞，邓志明掌管州中事务。邓克明又转而掠夺永丰、宁都、石城、汀州、宁化等县，于是攻陷了建昌，攻破了杉关，掠夺了光泽，路过顺昌，来攻打建宁，没有攻克，回兵占据了抚州。这年冬天（4058年），邓愈的军队逼近抚州，邓克明想要逃到新淦，没能成功，于是假装请求投降。邓愈察觉了他的欺诈，暗中派军队在夜间袭击并攻破了他的城池，邓克明这才出城投降。邓愈派遣邓志明返回新淦，收拢他原来的部属，送邓克明到九江，（邓克明）在半路上逃跑，又在洪都被抓获，（被）囚禁押送到建康。这一年（4061年），大都督朱文正派邓志明跟随出征赣州，邓志明却占据麻岭、沙坑、牛陂建立营寨，拒不接受命令不肯出发，到这时被擒拿，与邓克明一起被处死。邓克明兄弟凶暴残忍，统率部众毫无纪律，所过之处残害百姓，人们称他们为“邓贼”。
命令左相国徐达率领军队巡视荆湖等地。在此之前，陈友谅灭亡后，荆湘各郡大多归顺投降。到这时，皇上谕示徐达说：“如今武昌已经平定，湖南各郡相继归附，然而其中多是陈友谅的旧部，观望犹疑，也有山寨残余的贼寇，凭借险阻地势，聚集民众为害百姓。现在命令你巡视该地，应当安抚招徕，使百姓各自安居乐业，如有依仗险要作乱的，立即派兵铲除，不要给百姓留下祸患。”
戊戌，平章常遇春、参政邓愈平定各处山寨后，进军驻扎在吉安。当时饶鼎臣守卫吉安，常遇春派人告诉他说：“我现在要去攻取赣州，你可以出城来，我们谈几句话我就走。”饶鼎臣恐惧不敢出来，派他的小儿子出来相见，常遇春让他坐下喝酒，又赠送衣服，让他回去说：“回去告诉你父亲，他打算怎么办？躲着不见我。我要走了，不能为你停留，你们好自为之。”饶鼎臣当夜弃城逃往安福，常遇春于是收复吉安，便率兵奔赴赣州。
庚子，任命右副元帅王志为飞熊卫指挥使。
这个月，平章常遇春的军队到达赣州，熊天瑞固守城池不投降。皇上命令平章彭时中率兵与常遇春会合共同攻打。又命中书右司